پیش بینی فعالیت برخی از بازدارنده های کیناز با استفاده از روش های مدل سازی مولکولی: روش های فارماکوفوری و کیوسار سه بعدی

پایان نامه
چکیده

در این پایان نامه، مطالعات ارتباط کمی ساختار و فعالیت سه بعدی، الحاق مولکولی و غربالگری مجازی دو سری از بازدارنده های کیناز در راستای یافتن رابطه ای میان خواص مولکولی و فعالیت های زیستی و همچنین پیشنهاد ترکیبات جدید با خاصیت بازدارندگی بیشتر انجام شد. در مطالعه اول، مدل کیوسار سه بعدی جدید autogpa براساس انطباق فارماکوفوری برای مقایسه با دو مدل کومفا و کومسیا بر مبنای برخط کردن بر روی بیشترین زیر مجموعه ساختاری مشترک، تولید شد. غربالگری مجازی براساس مدل فارماکوفوری autogpa و الحاق مولکولی انجام گرفت و همچنین مطالعات admet روی ترکیبات پیشنهاد شده جدید انجام و با محدوده ها ی استاندارد مقایسه شدند. در مطالعه دوم، روش های انتخاب متغیر (روش جایگزینی پیشرفته و الگوریتم ژنتیک) به منظور مقایسه مدل کومفا با مدل های erm-pls و ga-plsبه کار گرفته شدند. اعتبارسنجی داخلی و خارجی برای ارزیابی پایداری و قدرت پیشگویی مدل ها نیز انجام گرفت. پارامترهای آماری برتری قدرت پیشگویی مدل autogpa و نیز برتری قابل توجه مدل ga-pls را به ترتیب در مطالعه اول و دوم نشان دادند. مطالعات الحاق مولکولی برای بررسی مکانیسم بازدارندگی ترکیبات نیز به کار گرفته شد.

منابع مشابه

مطالعه حفره های زیر سطحی با استفاده از روش تصویر سازی سه بعدی مقاومت الکتریکی

    کاربرد سه نوع آرایه الکترودی جهت شناسایی یک حفره زیرزمینی بررسی گردید. تصویر سازی سه بعدی مقاومت الکتریکی در امتداد هشت پروفیل موازی با استفاده از آرایه های الکترودی قطبی- قطبی، قطبی-دوقطبی و دوقطبی- دوقطبی با فاصله بین الکترودی یک متر  و شبکه مستطیلی صورت گرفت. برگردان سازی داده ها توسط یک الگوریتم وارون سازی  سه بعدی مبتنی بر روش برگردان سازی هوشمند انجام گردید.  جهت بدست آوردن نتایج بهتر...

متن کامل

پیش بینی و بهینه سازی برخی ویژگی های بیودیزل پالم با استفاده از خواص دی الکتریک به روش سطح پاسخ

استفاده از سامانه‌ پایش کیفی بیودیزل تولیدی (به­صورت برخط و ناپیوسته) همواره نیاز اساسی تولید این فرآورده است که نیازمند تحقیقاتی در این زمینه است. هدف از این تحقیق پیش­بینی و بهینه­ سازی ویژگی­های بیودیزل پالم با استفاده از خواص دی­الکتریک آن است. متغیرهای خواص دی­الکتریک بیودیزل (έ، ثابت دی­الکتریک و ″ε، فاکتور اتلاف) در فرکانس­ های مایکروویو (434، 915 و MHz 2450) به­ عنوان متغیرهای ورودی مور...

متن کامل

مدل سازی پیش بینی گردشگری ورودی به ایران با استفاده از روش هایARIMA و شبکه های عصبی فازی

صنعت گردشگری به عنوان یک صنعت پاک و اشتغالزا، در سال‎های اخیر جزء درآمدزاترین صنایع جهان بوده و همواره مورد توجه سیاست‎ها و برنامه‎های توسعه گرانه می‎باشد. دولت‎ها و بخش‎های خصوصی در سطوح کلان تا خرد جهت توسعه و بقاء در بخش گردشگری نیازمند پیش‎بینی تقاضا در این بخش می‎باشند. هر چند که اکثر مطالعات انجام گرفته جهت پیش‎بینی تقاضا در گردشگری از روش‎های کمی استفاده کرده‎اند ولی رویکردها و روش‎های ک...

متن کامل

کالیبره کردن مدل های پیش بینی تصادفات با استفاده از یک روش ابتکاری

در فرایند مدل سازی آماری تصادفات، برآورد دقیق ضرایب ثابت مدل (کالیبره کردن) از اهمیت زیادی برخورد است. زیرا، این ضرایب میزان و چگونگی ارتباط متغیرهای مستقل با متغیر وابسته را بیان کرده و بهمین جهت تخمین نادرست آنها می تواند به ارایه نتایج غیرواقعی توسط مدل منجرگردد. برای تعیین ضرایب ثابت مدل های پیش بینی تصادفات، معمولاً از فرایندی موسوم به حداکثر کردن تابع درستنمایی استفاده می شود که در آن رو...

متن کامل

پیش بینی ظرفیت تبادل کاتیونی خاک های ایران با استفاده از روش های گوناگون

اندازه گیری ظرفیت تبادل کاتیونی خاک در سطوح وسیع، بسیار پرهزینه و وقت گیر است. برآورد این خصوصیت به­وسیله ویژگی‌های زودیافت خاک، از طریق روش‌های پارامتریک و غیرپارامتریک (توابع انتقالی) می‌تواند رویکرد مناسبی باشد. در این پژوهش، روش پارامتریک رگرسیون‌های خطی و غیر خطی و روش‌های غیر پارامتریک شبکه‌های عصبی مصنوعی، رگرسیون درختی و فازی عصبی در تخمین ظرفیت تبادل کاتیونی خاک مورد استفاده قرار گرفت....

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی - دانشکده شیمی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023